Das Kreiskommando Thurgau ist Auskunfts- und Kontrollstelle für alle im Kanton wohnhaften Stellungs- und Wehrpflichtigen. Es stellt sicher, dass die stellungspflichtigen Bürger erfasst und zu einem Orientierungstag aufgeboten werden. Weiter ist das Kreiskommando Thurgau zuständig für alle Dienstverschiebungen, den Vollzug von militärischen Disziplinarstrafen, sowie die Beratung und Information aller militärischen Belangen. In Zusammenarbeit mit den Gemeinden stellt das Kreiskommando Thurgau die Kontrollführung aller im Kanton wohnhaften wehrpflichtigen Bürger sicher und setzt die Meldepflicht durch.
Für den Zivilschutz ist das Amt für die Aus- und Weiterbildung der Schutzdienstpflichtigen auf sämtlichen Stufen zuständig. Für die Zivilschutzorganisationen liefert das Amt Grundlagen und übt als kantonales Organ beratende Funktionen zugunsten der Bezirke aus.

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